本署為建構健康友善、免受霸凌侵犯之職場環境，建立職場霸凌申訴管道，並確實維護當事人之權益。
有關職場霸凌事件之申訴，申訴人應親自或委任代理人向所屬單位各級主管或人事室或秘書室提出申訴，並填具申訴書;本署首長如涉及職場霸凌事件，應送農業部申訴處理調查小組辦理。
本署職場霸凌申訴管道如下:
  (一)  申訴專線電話：02-23516633轉5871 
  (二)  申訴傳真：02-33936927 
  (三)  申訴電子信箱：help@afna.gov.tw